Generalinio direktoriaus darbo užmokestis nustatomas vadovaujantis Vyriausybės nutarimu Nr.1341 „Dėl valstybės valdomų įmonių vadovų darbo užmokesčio“ (toliau — Nutarimas), sprendimą priima akcininkas (Finansų ministerija). Generalinio direktoriaus darbo užmokestį sudaro pastovioji ir kintamoji darbo užmokesčio dalis.

Pastovioji darbo užmokesčio dalis nustatoma pagal VIPA kategoriją atsižvelgiant į praėjusių finansinių metų rodiklius. Nuo 2019 m. birželio 1 d. pasiekus rodiklius VIPA priskirta I kategorijai ir nustatytas pastoviosios dalies koeficientas 19,2. Koeficientas dauginamas iš atitinkamų metų LR Seimo nustatytą Lietuvos Respublikos valstybės politikų, teisėjų, valstybės pareigūnų ir valstybės tarnautojų pareiginės algos (atlyginimo) bazinio dydžio. Nustatyta kategorija ir koeficientas galioja 2020 m. ir 2021 m. 

2020 m. kintamoji darbo užmokesčio dalis skirta maksimali 50 % mėnesinės algos pastoviosios dalies pagal 2020 m. balandžio 30 d. Finansų ministro įsakymą Nr. MI-402 „Dėl uždarosios akcinės bendrovės Viešųjų investicijų plėtros agentūros generalinio direktoriaus mėnesinės algos pastoviosios ir kintamosios dalių dydžių nustatymo pakeitimo“ už pasiektus 2019 m. rodiklius.

– LR Finansų ministro 2020 m. lapkričio  30 d.  įsakymas „Dėl uždarosios akcinės bendrovės Viešųjų investicijų plėtros agentūros 2020 metų veiklos vertinamų rodiklių, nuo kurių priklauso bendrovės generalinio direktoriaus 2021 m. mėnesinės algos kintamoji dalis, patvirtinimo“;

– LR Finansų ministro 2019 m. balandžio 30 d.  įsakymas  NR. 1K-138 „Dėl nepriklausomo uždarosios akcinės bendrovės Viešųjų investicijų plėtros agentūros stebėtojų tarybos nario atlygio už veiklą stebėtojų taryboje nustatymo“;

– Uždarosios akcinės bendrovės Viešųjų investicijų plėtros agentūros generalinio direktoriaus įsakymu (2020 m. gegužės 11 d. Nr. 2020/9-40 redakcija) patvirtinta uždarosios akcinės bendrovės Viešųjų investicijų plėtros agentūros atlygio sistema. 

– LR Finansų ministro 2019 m. liepos 31 d.  įsakymas Nr. 1K -228 “ Dėl uždarosios akcinės bendrovės Viešųjų investicijų plėtros agentūros veiklos vertinimo rodiklių, nuo kurių priklauso bendrovės generalinio direktoriaus mėnesinės algos kintamoji dalis, patvirtinimo“. 

– LR Finansų ministro 2020 m. balandžio 30 d.  įsakymas Nr. MI -402 „Dėl Finansų ministro 2019 m. kovo 28 d. įsakymo Nr. MI-255 „Dėl uždarosios akcinės bendrovės Viešųjų investicijų plėtros agentūros generalinio direktoriaus mėnesinės algos pastoviosios ir kintamosios dalių dydžių nustatymo“ pakeitimo“.